MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ignicoccus hospitalis KIN4/I chromosome

Total Repeats: 29075

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009776	CTC	2	6	111	116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_009776	GCA	2	6	160	165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936796
3	NC_009776	TAT	2	6	203	208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156936796
4	NC_009776	TCG	3	9	228	236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936796
5	NC_009776	CCG	2	6	280	285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156936796
6	NC_009776	ACA	2	6	298	303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156936796
7	NC_009776	CCCTT	2	10	337	346	0 %	40 %	0 %	60 %	156936796
8	NC_009776	TTG	2	6	362	367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	156936796
9	NC_009776	CCTCG	2	10	374	383	0 %	20 %	20 %	60 %	156936796
10	NC_009776	TGC	2	6	418	423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936796
11	NC_009776	TCC	2	6	438	443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156936796
12	NC_009776	TCA	2	6	445	450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156936796
13	NC_009776	CTA	2	6	493	498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156936796
14	NC_009776	TCT	2	6	580	585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156936796
15	NC_009776	CCT	2	6	586	591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156936796
16	NC_009776	CTC	2	6	611	616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156936796
17	NC_009776	CCT	2	6	667	672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156936796
18	NC_009776	CTA	2	6	766	771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156936796
19	NC_009776	TC	3	6	774	779	0 %	50 %	0 %	50 %	156936796
20	NC_009776	TTC	2	6	825	830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156936796
21	NC_009776	CCTT	2	8	885	892	0 %	50 %	0 %	50 %	156936796
22	NC_009776	TC	3	6	921	926	0 %	50 %	0 %	50 %	156936796
23	NC_009776	ACG	2	6	969	974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936796
24	NC_009776	GCG	2	6	1035	1040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156936796
25	NC_009776	CCT	2	6	1045	1050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156936796
26	NC_009776	CCG	2	6	1143	1148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156936796
27	NC_009776	TTA	2	6	1171	1176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156936796
28	NC_009776	CAT	2	6	1180	1185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156936796
29	NC_009776	CTC	2	6	1220	1225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156936796
30	NC_009776	ATA	2	6	1236	1241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	156936796
31	NC_009776	AGTT	2	8	1381	1388	25 %	50 %	25 %	0 %	156936796
32	NC_009776	TTG	2	6	1452	1457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	156936796
33	NC_009776	TC	3	6	1463	1468	0 %	50 %	0 %	50 %	156936796
34	NC_009776	CCT	2	6	1474	1479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156936796
35	NC_009776	TGGT	2	8	1508	1515	0 %	50 %	50 %	0 %	156936796
36	NC_009776	CGC	2	6	1556	1561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156936796
37	NC_009776	ACG	2	6	1641	1646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936796
38	NC_009776	CGC	2	6	1669	1674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156936796
39	NC_009776	CAG	2	6	1724	1729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936796
40	NC_009776	TCT	2	6	1762	1767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156936796
41	NC_009776	CTA	2	6	1855	1860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156936796
42	NC_009776	GCC	2	6	2010	2015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_009776	ACC	2	6	2035	2040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_009776	CT	3	6	2043	2048	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_009776	CGG	2	6	2090	2095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_009776	CCG	2	6	2097	2102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_009776	TCT	2	6	2141	2146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156936797
48	NC_009776	CTT	2	6	2181	2186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156936797
49	NC_009776	TCG	2	6	2215	2220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936797
50	NC_009776	GAG	2	6	2247	2252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156936797
51	NC_009776	CGC	2	6	2267	2272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156936797
52	NC_009776	GAT	2	6	2307	2312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156936797
53	NC_009776	CTC	2	6	2346	2351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156936797
54	NC_009776	TCG	2	6	2623	2628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936797
55	NC_009776	CAA	2	6	2790	2795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156936797
56	NC_009776	CTC	2	6	2806	2811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156936797
57	NC_009776	CCA	2	6	2873	2878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156936797
58	NC_009776	TGG	2	6	2884	2889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156936797
59	NC_009776	TGC	2	6	2903	2908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936797
60	NC_009776	TCT	2	6	2909	2914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156936797
61	NC_009776	CCG	2	6	3013	3018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156936797
62	NC_009776	TGG	2	6	3023	3028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156936797
63	NC_009776	CTA	2	6	3029	3034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156936797
64	NC_009776	CGC	2	6	3035	3040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156936797
65	NC_009776	TCT	2	6	3093	3098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156936797
66	NC_009776	CCAG	2	8	3126	3133	25 %	0 %	25 %	50 %	156936797
67	NC_009776	GCG	2	6	3353	3358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156936797
68	NC_009776	GGTAA	2	10	3366	3375	40 %	20 %	40 %	0 %	156936797
69	NC_009776	CAA	2	6	3381	3386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156936797
70	NC_009776	TCG	2	6	3391	3396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936797
71	NC_009776	GAGGG	2	10	3414	3423	20 %	0 %	80 %	0 %	156936797
72	NC_009776	TC	3	6	3491	3496	0 %	50 %	0 %	50 %	156936798
73	NC_009776	TTA	2	6	3531	3536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156936798
74	NC_009776	CTG	2	6	3583	3588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936798
75	NC_009776	CG	3	6	3770	3775	0 %	0 %	50 %	50 %	156936798
76	NC_009776	A	7	7	3888	3894	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009776	GGT	2	6	3978	3983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009776	CAC	2	6	4008	4013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_009776	GAA	2	6	4053	4058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156936799
80	NC_009776	CGT	2	6	4079	4084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936799
81	NC_009776	TCC	2	6	4126	4131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156936799
82	NC_009776	GAC	2	6	4185	4190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936799
83	NC_009776	AAT	2	6	4226	4231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	156936799
84	NC_009776	GTG	2	6	4247	4252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156936799
85	NC_009776	AG	3	6	4259	4264	50 %	0 %	50 %	0 %	156936799
86	NC_009776	TAC	2	6	4311	4316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156936799
87	NC_009776	GAAG	2	8	4324	4331	50 %	0 %	50 %	0 %	156936799
88	NC_009776	GGA	2	6	4333	4338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156936799
89	NC_009776	GAG	2	6	4355	4360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156936799
90	NC_009776	GGAA	2	8	4361	4368	50 %	0 %	50 %	0 %	156936799
91	NC_009776	GAA	2	6	4385	4390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156936799
92	NC_009776	GTG	2	6	4394	4399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156936799
93	NC_009776	CTC	2	6	4449	4454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156936799
94	NC_009776	AGG	2	6	4465	4470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156936799
95	NC_009776	ATA	2	6	4494	4499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	156936799
96	NC_009776	AGG	2	6	4580	4585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156936799
97	NC_009776	G	6	6	4613	4618	0 %	0 %	100 %	0 %	156936800
98	NC_009776	G	6	6	4701	4706	0 %	0 %	100 %	0 %	156936800
99	NC_009776	ACC	2	6	4721	4726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156936800
100	NC_009776	CTC	2	6	4756	4761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156936800
101	NC_009776	CCT	2	6	4800	4805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156936800
102	NC_009776	CT	3	6	5042	5047	0 %	50 %	0 %	50 %	156936800
103	NC_009776	CAA	2	6	5135	5140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156936800
104	NC_009776	CAG	2	6	5172	5177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936800
105	NC_009776	GCC	2	6	5185	5190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156936800
106	NC_009776	TAG	2	6	5216	5221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156936800
107	NC_009776	CTC	2	6	5227	5232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156936800
108	NC_009776	GACG	2	8	5242	5249	25 %	0 %	50 %	25 %	156936800
109	NC_009776	CTT	2	6	5257	5262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156936800
110	NC_009776	GGCC	2	8	5315	5322	0 %	0 %	50 %	50 %	156936801
111	NC_009776	TCT	2	6	5392	5397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156936801
112	NC_009776	TCGAG	2	10	5403	5412	20 %	20 %	40 %	20 %	156936801
113	NC_009776	CTC	2	6	5458	5463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156936801
114	NC_009776	CTT	2	6	5478	5483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156936801
115	NC_009776	GTC	2	6	5498	5503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936801
116	NC_009776	AGA	2	6	5542	5547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156936801
117	NC_009776	ACC	2	6	5557	5562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156936801
118	NC_009776	AAC	2	6	5568	5573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156936801
119	NC_009776	CGC	2	6	5611	5616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156936801
120	NC_009776	TCC	2	6	5628	5633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156936801
121	NC_009776	GC	3	6	5674	5679	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_009776	TCGCA	2	10	5695	5704	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
123	NC_009776	ATT	2	6	5705	5710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156936802
124	NC_009776	CCT	2	6	5751	5756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156936802
125	NC_009776	GCC	2	6	5759	5764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156936802
126	NC_009776	GCTT	2	8	5771	5778	0 %	50 %	25 %	25 %	156936802
127	NC_009776	CTT	2	6	5791	5796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156936802
128	NC_009776	CCT	3	9	5824	5832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156936802
129	NC_009776	CT	3	6	5868	5873	0 %	50 %	0 %	50 %	156936802
130	NC_009776	ACG	2	6	5879	5884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936802
131	NC_009776	TCC	2	6	5894	5899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156936802
132	NC_009776	CAA	2	6	5912	5917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156936802
133	NC_009776	AG	3	6	5951	5956	50 %	0 %	50 %	0 %	156936802
134	NC_009776	CT	3	6	5977	5982	0 %	50 %	0 %	50 %	156936802
135	NC_009776	CTT	2	6	6022	6027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156936802
136	NC_009776	CCT	2	6	6030	6035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156936802
137	NC_009776	CAT	2	6	6064	6069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156936802
138	NC_009776	TCT	2	6	6083	6088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156936802
139	NC_009776	CCT	2	6	6094	6099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156936802
140	NC_009776	AGTT	2	8	6100	6107	25 %	50 %	25 %	0 %	156936802
141	NC_009776	ACGCC	2	10	6147	6156	20 %	0 %	20 %	60 %	156936802
142	NC_009776	GGTC	2	8	6165	6172	0 %	25 %	50 %	25 %	156936802
143	NC_009776	TCCA	2	8	6269	6276	25 %	25 %	0 %	50 %	156936802
144	NC_009776	CCT	2	6	6328	6333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156936802
145	NC_009776	ACTTG	2	10	6339	6348	20 %	40 %	20 %	20 %	156936802
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153	NC_009776	GA	3	6	6642	6647	50 %	0 %	50 %	0 %	156936802
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157	NC_009776	CTCTTG	2	12	7118	7129	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	156936802
158	NC_009776	GA	3	6	7164	7169	50 %	0 %	50 %	0 %	156936802
159	NC_009776	TCCAG	2	10	7185	7194	20 %	20 %	20 %	40 %	156936802
160	NC_009776	ATC	2	6	7220	7225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156936802
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163	NC_009776	GCT	2	6	7408	7413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936802
164	NC_009776	TTC	2	6	7430	7435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156936802
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166	NC_009776	TCT	2	6	7554	7559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156936802
167	NC_009776	GCC	2	6	7640	7645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156936802
168	NC_009776	TTG	2	6	7807	7812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	156936803
169	NC_009776	CGA	3	9	7839	7847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936803
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171	NC_009776	AT	3	6	7885	7890	50 %	50 %	0 %	0 %	156936803
172	NC_009776	AAG	2	6	7897	7902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156936803
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178	NC_009776	AG	3	6	8195	8200	50 %	0 %	50 %	0 %	156936803
179	NC_009776	TAG	2	6	8246	8251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156936803
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182	NC_009776	GGAG	2	8	8351	8358	25 %	0 %	75 %	0 %	156936803
183	NC_009776	ACG	2	6	8408	8413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936803
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188	NC_009776	CTG	2	6	8664	8669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936804
189	NC_009776	TAT	2	6	8687	8692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156936804
190	NC_009776	GCT	2	6	8744	8749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936804
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194	NC_009776	CCT	2	6	9013	9018	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156936804
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197	NC_009776	GCCA	2	8	9120	9127	25 %	0 %	25 %	50 %	156936804
198	NC_009776	TA	3	6	9180	9185	50 %	50 %	0 %	0 %	156936804
199	NC_009776	GCACC	2	10	9187	9196	20 %	0 %	20 %	60 %	156936804
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219	NC_009776	GTC	2	6	10499	10504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936804
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222	NC_009776	TTA	2	6	10727	10732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156936805
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225	NC_009776	TAT	2	6	10824	10829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156936805
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232	NC_009776	TAG	3	9	11030	11038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156936806
233	NC_009776	AG	3	6	11065	11070	50 %	0 %	50 %	0 %	156936806
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237	NC_009776	CGT	2	6	11256	11261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936806
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241	NC_009776	CAT	2	6	11530	11535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156936807
242	NC_009776	GAA	2	6	11614	11619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156936807
243	NC_009776	AG	3	6	11639	11644	50 %	0 %	50 %	0 %	156936807
244	NC_009776	CGA	2	6	11650	11655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936807
245	NC_009776	AGCA	2	8	11670	11677	50 %	0 %	25 %	25 %	156936807
246	NC_009776	TA	3	6	11679	11684	50 %	50 %	0 %	0 %	156936807
247	NC_009776	GAC	2	6	11693	11698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936807
248	NC_009776	GAAG	2	8	11755	11762	50 %	0 %	50 %	0 %	156936807
249	NC_009776	GGAAG	2	10	11764	11773	40 %	0 %	60 %	0 %	156936807
250	NC_009776	GAAG	2	8	11875	11882	50 %	0 %	50 %	0 %	156936807
251	NC_009776	GTC	2	6	11939	11944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
252	NC_009776	ATC	2	6	11945	11950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156936808
253	NC_009776	TCA	2	6	12038	12043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156936808
254	NC_009776	AAG	2	6	12055	12060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156936808
255	NC_009776	TTC	3	9	12076	12084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156936808
256	NC_009776	TC	3	6	12109	12114	0 %	50 %	0 %	50 %	156936808
257	NC_009776	CCTT	2	8	12119	12126	0 %	50 %	0 %	50 %	156936808
258	NC_009776	GCA	2	6	12221	12226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936808
259	NC_009776	AGGAG	2	10	12272	12281	40 %	0 %	60 %	0 %	156936808
260	NC_009776	AC	3	6	12304	12309	50 %	0 %	0 %	50 %	156936808
261	NC_009776	AAGG	2	8	12317	12324	50 %	0 %	50 %	0 %	156936808
262	NC_009776	CTC	2	6	12330	12335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156936808
263	NC_009776	CAA	2	6	12360	12365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156936808
264	NC_009776	GGC	2	6	12399	12404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156936808
265	NC_009776	GAG	2	6	12540	12545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156936808
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267	NC_009776	TTC	3	9	12597	12605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156936808
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396	NC_009776	AAC	2	6	18945	18950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156936812
397	NC_009776	CCG	2	6	18963	18968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156936812
398	NC_009776	GACG	2	8	19100	19107	25 %	0 %	50 %	25 %	156936812
399	NC_009776	CCCT	2	8	19200	19207	0 %	25 %	0 %	75 %	156936812
400	NC_009776	CCA	2	6	19213	19218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156936812
401	NC_009776	CGA	2	6	19267	19272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936812
402	NC_009776	GCC	2	6	19281	19286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156936812
403	NC_009776	CGA	2	6	19312	19317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936812
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407	NC_009776	TTA	2	6	19499	19504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156936812
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452	NC_009776	GTG	2	6	21493	21498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156936814
453	NC_009776	CCT	2	6	21520	21525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156936814
454	NC_009776	GTG	2	6	21576	21581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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480	NC_009776	CGA	2	6	22592	22597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936816
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497	NC_009776	CCA	3	9	23391	23399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156936817
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499	NC_009776	GTC	2	6	23446	23451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936817
500	NC_009776	AAGG	2	8	23562	23569	50 %	0 %	50 %	0 %	156936817

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